A Certain Scientific Accelerator

Accelerator erholt sich nach dem Level-6-Shift-Projekt im Krankenhaus von der Kugel, die er sich eingefangen hat. Derweil stiehlt jemand ein geheimes, experimentelles Waffensystem, das gegen ihn entwickelt wurde. Und so dauert es nicht lange, bis die Diebe im Krankenhaus auftauchen, in dem Accelerator sich aufhält.

Ein mysteriöser Unbekannter dringt in das Krankenhaus ein, in dem Accelerator sich erholt. Ihm dicht auf den Fersen Soldaten, die sich als Anti-Skill ausweisen. Die Verfolgung endet in Accelerators Krankenzimmer, dem danach auffällt, dass der Unbekannte ein Foto von Last Order fallen ließ. Dieser Sache muss Accelerator natürlich nachgehen, doch er ahnt nicht, in was er sich damit hineinmanövriert.

Esther führt Accelerator zur Lagerhalle, in der sie gefangen gehalten wurde. Dort bietet sich ihnen ein schockierender Anblick, doch sie haben keine Zeit, diesen zu verdauen. Esther muss sich an Ort und Stelle ihrer Vergangenheit stellen. Außerdem findet eine verdutzte Last Order später Esther auf Accelerators Bett vor.

Accelerator verhindert den Plan der beiden DA-Mitglieder, Hitokawa Hasami mit einer chemischen Lösung aus dem Weg zu räumen. In diesem Moment rührt sich Hasamis zuvor lebloser Körper unter Einfluss von Esthers Huotou und schreitet zur Tat. Außerdem bringen sowohl Yoshikawa als auch Yomikawa mehr über DA in Erfahrung. Und auch für DA wird es langsam brenzlig.

Accelerator erholt sich im Krankenhaus während anderorts Anti-Skill einen Unterschlupf DAs stürmt, zu dem auch Esther und die wiederbelebte Hasami unterwegs sind. Hishigata versucht derweil, DA dazu zu bewegen, ihm ihre Geisel zu bringen, eine der Sisters. Doch nicht nur er ist hinter der Sister her. Als die von Nakimoto auf DA angesetzte Truppe von ihr erfährt, sind auch sie schnell ganz scharf auf sie.

Während sich Anti-Skill und DA einen erbitterten Kampf liefern, tauchen auf einmal vier Kinder auf. Kinder, die sich als Aufräumtruppe Nakimotos entpuppen. Anti-Skill und DA begreifen schnell, dass sie ihnen nicht viel entgegenzusetzen haben, doch Yomikawa will um jeden Preis die Sister schützen. Und Esther versucht zu verhindern, dass noch mehr Leute ihretwegen zu Schaden kommen.

Accelerator gelingt es, die Scavenger zu besiegen, wodurch die Leute von Anti-Skill, Esther und das Huotou sowie die Sister gerettet scheinen, doch die Ruhe währt nicht lange. Denn Hishigata bietet ganze drei Särge auf, mit besonderen Seelen bestückt, den Geistern der Numbers, um die Sister in die Finger zu bekommen. Doch da hat er die Rechnung ohne Accelerator gemacht.

Einige Zeit vor den aktuellen Geschehnissen schöpft ein gewisser Hishigata in einem gewissen Forschungslabor neue Hoffnung für sein Projekt, als sein Team von einer Totenbeschwörerin namens Esther verstärkt wird. Esther ihrerseits freundet sich schnell mit Hishigatas kleiner Schwester, Hirumi, an, die unbedingt eine Level 6er werden will. Jedoch wissen weder Esther noch Hishigata um die Gründe für ihre Versessenheit.

Durch die Daten der Erinnerungen an 10.031 Tode, die sie aus der Sister extrahieren, gelingt es Hishigata und Hirumi die Formel zu vervollständigen. Während sie Hirumi darauf vorbereiten, ein Level 6er zu werden, lenken sie Accelerator mit den, nun durch die Formel verstärkten, Särgen ab. Derweil hat Esther sich entschlossen, die beiden aufzuhalten.

Hishigata und Hirumi haben ihr Ziel erreicht. Mit der Formel der 10.031 Tode der Sisters ist es ihnen gelungen, Hirumi zu einem Level 6er zu machen. Und nun, da Hishigata im Sterben liegt, braucht Hirumi nicht länger vorzugaukeln Hirumi zu sein und offenbart, wer sie in Wahrheit ist und was sie im Schilde führt. Nun stellt sich die Frage, ob ein Level 6er Monster überhaupt aufzuhalten ist und wenn ja von wem.

Isaac Rosenthal, das vierte Familienoberhaupt der Rosenthals, der sich von seinem Sohn Nathan vor dem Tod in die Pseudo-Seele Taowus übertragen ließ, versucht nun mit Hirumis Körper einen perfekten Golem zu erschaffen. Die Einzigen, die ihn daran hindern können, sind Accelerator, Esther und ihre Gefährten.

Esther hat vor, mit ihrer Klinge des Kaisers Shun Isaac zu bezwingen, doch dafür müssen sie zuerst bis zu seinem Hauptkörper vordringen. Isaac entwickelt sich derweil weiter fort und erlangt einem Gott ebenbürtige Macht, als er zum perfekten Golem wird. Und das alles während Accelerator der Akku ausgeht.